Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSR2Q969E8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSR2Q969E8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms