Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHF3Q92576 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms