Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms