Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRRN4Q8WUT4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms