Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms