Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHE22Q8NFJ8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BHLHE22Q8NFJ8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms