Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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ZNF548Q8NEK5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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ZNF548Q8NEK5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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ZNF548Q8NEK5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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ZNF548Q8NEK5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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ZNF548Q8NEK5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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