Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACBD4Q8NC06 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms