Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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DTX3Q8N9I9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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DTX3Q8N9I9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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DTX3Q8N9I9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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DTX3Q8N9I9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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DTX3Q8N9I9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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DTX3Q8N9I9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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DTX3Q8N9I9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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DTX3Q8N9I9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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DTX3Q8N9I9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX3Q8N9I9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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