Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHCHD4Q8N4Q1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHCHD4Q8N4Q1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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