Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXP5

C11orf53, Uncharacterized protein C11orf53, humanhuman

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf53Q8IXP5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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C11orf53Q8IXP5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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C11orf53Q8IXP5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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C11orf53Q8IXP5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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C11orf53Q8IXP5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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C11orf53Q8IXP5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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C11orf53Q8IXP5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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C11orf53Q8IXP5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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C11orf53Q8IXP5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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C11orf53Q8IXP5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C11orf53Q8IXP5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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