Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC103Q8IW40 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms