Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRAG1Q86YV5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAG1Q86YV5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAG1Q86YV5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAG1Q86YV5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAG1Q86YV5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAG1Q86YV5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAG1Q86YV5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAG1Q86YV5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAG1Q86YV5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms