Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC29A4Q7RTT9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms