Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms