Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL4Q6XD76 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms