Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSSK4Q6SA08 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms