Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED9Q6R2W3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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