Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOA5Q6Q788 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA5Q6Q788 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms