Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
REEP3Q6NUK4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
REEP3Q6NUK4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms