Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC3HQ6NTF7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC3HQ6NTF7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms