Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LCN10Q6JVE6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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LCN10Q6JVE6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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LCN10Q6JVE6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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LCN10Q6JVE6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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LCN10Q6JVE6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LCN10Q6JVE6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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