Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf135Q5VTT2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf135Q5VTT2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms