Protein–RNA interactions for Protein: Q5T200

ZC3H13, Zinc finger CCCH domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H13Q5T200 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H13Q5T200 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZC3H13Q5T200 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms