Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CELF3Q5SZQ8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms