Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM74A1Q5RGS3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A1Q5RGS3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms