Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COLEC12Q5KU26 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLEC12Q5KU26 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms