Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KHDC3LQ587J8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms