Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms