Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SBK1Q52WX2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SBK1Q52WX2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms