Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP6Q3SY56 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms