Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-BQ31612 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms