Protein–RNA interactions for Protein: Q29RF7

PDS5A, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5AQ29RF7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDS5AQ29RF7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDS5AQ29RF7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms