Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM187BQ17R55 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms