Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP2B3Q16720 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
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