Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNAPC1Q16533 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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