Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDB1Q16531 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DDB1Q16531 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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