Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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