Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PUM3Q15397 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUM3Q15397 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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