Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX1-1Q15270 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX1-1Q15270 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms