Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDK2Q15119 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK2Q15119 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK2Q15119 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK2Q15119 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK2Q15119 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK2Q15119 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK2Q15119 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms