Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSME4Q14997 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSME4Q14997 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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