Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM25Q14258 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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