Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CKAP5Q14008 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CKAP5Q14008 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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