Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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PDE6HQ13956 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PDE6HQ13956 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PDE6HQ13956 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PDE6HQ13956 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PDE6HQ13956 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PDE6HQ13956 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PDE6HQ13956 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PDE6HQ13956 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PDE6HQ13956 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PDE6HQ13956 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PDE6HQ13956 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PDE6HQ13956 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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