Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTB1Q13884 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms