Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALCAMQ13740 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALCAMQ13740 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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