Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL1Q13616 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL1Q13616 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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