Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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PEX6Q13608 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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PEX6Q13608 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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PEX6Q13608 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX6Q13608 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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