Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRPF4BQ13523 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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